Protein–RNA interactions for Protein: A5YKK6

CNOT1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT1A5YKK6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNOT1A5YKK6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNOT1A5YKK6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CNOT1A5YKK6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CNOT1A5YKK6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNOT1A5YKK6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNOT1A5YKK6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNOT1A5YKK6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNOT1A5YKK6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNOT1A5YKK6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNOT1A5YKK6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNOT1A5YKK6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNOT1A5YKK6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNOT1A5YKK6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNOT1A5YKK6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CNOT1A5YKK6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNOT1A5YKK6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CNOT1A5YKK6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CNOT1A5YKK6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CNOT1A5YKK6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNOT1A5YKK6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNOT1A5YKK6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNOT1A5YKK6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNOT1A5YKK6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CNOT1A5YKK6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNOT1A5YKK6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNOT1A5YKK6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNOT1A5YKK6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CNOT1A5YKK6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CNOT1A5YKK6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNOT1A5YKK6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNOT1A5YKK6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNOT1A5YKK6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNOT1A5YKK6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNOT1A5YKK6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNOT1A5YKK6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNOT1A5YKK6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CNOT1A5YKK6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNOT1A5YKK6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CNOT1A5YKK6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CNOT1A5YKK6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CNOT1A5YKK6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
CNOT1A5YKK6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNOT1A5YKK6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNOT1A5YKK6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNOT1A5YKK6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNOT1A5YKK6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNOT1A5YKK6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNOT1A5YKK6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNOT1A5YKK6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNOT1A5YKK6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNOT1A5YKK6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CNOT1A5YKK6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNOT1A5YKK6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNOT1A5YKK6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNOT1A5YKK6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNOT1A5YKK6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNOT1A5YKK6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CNOT1A5YKK6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CNOT1A5YKK6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNOT1A5YKK6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNOT1A5YKK6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNOT1A5YKK6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNOT1A5YKK6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNOT1A5YKK6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNOT1A5YKK6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNOT1A5YKK6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNOT1A5YKK6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNOT1A5YKK6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CNOT1A5YKK6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNOT1A5YKK6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNOT1A5YKK6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNOT1A5YKK6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNOT1A5YKK6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNOT1A5YKK6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CNOT1A5YKK6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNOT1A5YKK6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNOT1A5YKK6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNOT1A5YKK6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNOT1A5YKK6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNOT1A5YKK6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNOT1A5YKK6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNOT1A5YKK6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNOT1A5YKK6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNOT1A5YKK6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNOT1A5YKK6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNOT1A5YKK6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNOT1A5YKK6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNOT1A5YKK6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNOT1A5YKK6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CNOT1A5YKK6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNOT1A5YKK6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNOT1A5YKK6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNOT1A5YKK6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CNOT1A5YKK6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNOT1A5YKK6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNOT1A5YKK6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNOT1A5YKK6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNOT1A5YKK6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CNOT1A5YKK6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms