Protein–RNA interactions for Protein: A0AVT1

UBA6, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA6A0AVT1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBA6A0AVT1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBA6A0AVT1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBA6A0AVT1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBA6A0AVT1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBA6A0AVT1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBA6A0AVT1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
UBA6A0AVT1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBA6A0AVT1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBA6A0AVT1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBA6A0AVT1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBA6A0AVT1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBA6A0AVT1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBA6A0AVT1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
UBA6A0AVT1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBA6A0AVT1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBA6A0AVT1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBA6A0AVT1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBA6A0AVT1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBA6A0AVT1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBA6A0AVT1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBA6A0AVT1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBA6A0AVT1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
UBA6A0AVT1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBA6A0AVT1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBA6A0AVT1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBA6A0AVT1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBA6A0AVT1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBA6A0AVT1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBA6A0AVT1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBA6A0AVT1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBA6A0AVT1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBA6A0AVT1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBA6A0AVT1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBA6A0AVT1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBA6A0AVT1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBA6A0AVT1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBA6A0AVT1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBA6A0AVT1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBA6A0AVT1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBA6A0AVT1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBA6A0AVT1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBA6A0AVT1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBA6A0AVT1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBA6A0AVT1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBA6A0AVT1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBA6A0AVT1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBA6A0AVT1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBA6A0AVT1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBA6A0AVT1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBA6A0AVT1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBA6A0AVT1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBA6A0AVT1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBA6A0AVT1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBA6A0AVT1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBA6A0AVT1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBA6A0AVT1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBA6A0AVT1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBA6A0AVT1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBA6A0AVT1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBA6A0AVT1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBA6A0AVT1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBA6A0AVT1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBA6A0AVT1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
UBA6A0AVT1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBA6A0AVT1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBA6A0AVT1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBA6A0AVT1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBA6A0AVT1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBA6A0AVT1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBA6A0AVT1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBA6A0AVT1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBA6A0AVT1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBA6A0AVT1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBA6A0AVT1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBA6A0AVT1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBA6A0AVT1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBA6A0AVT1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBA6A0AVT1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBA6A0AVT1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBA6A0AVT1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
UBA6A0AVT1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBA6A0AVT1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBA6A0AVT1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
UBA6A0AVT1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBA6A0AVT1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBA6A0AVT1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBA6A0AVT1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBA6A0AVT1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBA6A0AVT1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBA6A0AVT1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBA6A0AVT1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBA6A0AVT1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBA6A0AVT1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBA6A0AVT1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBA6A0AVT1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBA6A0AVT1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
UBA6A0AVT1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBA6A0AVT1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBA6A0AVT1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms