Protein–RNA interactions for Protein: A0A539

TCRBV7S3A2, T-cell receptor beta variable 4-2 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV7S3A2A0A539 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCRBV7S3A2A0A539 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCRBV7S3A2A0A539 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCRBV7S3A2A0A539 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCRBV7S3A2A0A539 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCRBV7S3A2A0A539 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCRBV7S3A2A0A539 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCRBV7S3A2A0A539 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TCRBV7S3A2A0A539 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCRBV7S3A2A0A539 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TCRBV7S3A2A0A539 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCRBV7S3A2A0A539 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCRBV7S3A2A0A539 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCRBV7S3A2A0A539 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCRBV7S3A2A0A539 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TCRBV7S3A2A0A539 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCRBV7S3A2A0A539 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TCRBV7S3A2A0A539 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCRBV7S3A2A0A539 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCRBV7S3A2A0A539 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCRBV7S3A2A0A539 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCRBV7S3A2A0A539 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCRBV7S3A2A0A539 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCRBV7S3A2A0A539 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCRBV7S3A2A0A539 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCRBV7S3A2A0A539 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCRBV7S3A2A0A539 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TCRBV7S3A2A0A539 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TCRBV7S3A2A0A539 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCRBV7S3A2A0A539 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCRBV7S3A2A0A539 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCRBV7S3A2A0A539 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCRBV7S3A2A0A539 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TCRBV7S3A2A0A539 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TCRBV7S3A2A0A539 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCRBV7S3A2A0A539 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCRBV7S3A2A0A539 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCRBV7S3A2A0A539 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCRBV7S3A2A0A539 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCRBV7S3A2A0A539 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCRBV7S3A2A0A539 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCRBV7S3A2A0A539 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCRBV7S3A2A0A539 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCRBV7S3A2A0A539 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCRBV7S3A2A0A539 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCRBV7S3A2A0A539 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TCRBV7S3A2A0A539 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCRBV7S3A2A0A539 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCRBV7S3A2A0A539 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCRBV7S3A2A0A539 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCRBV7S3A2A0A539 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCRBV7S3A2A0A539 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCRBV7S3A2A0A539 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCRBV7S3A2A0A539 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCRBV7S3A2A0A539 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCRBV7S3A2A0A539 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCRBV7S3A2A0A539 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TCRBV7S3A2A0A539 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCRBV7S3A2A0A539 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCRBV7S3A2A0A539 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCRBV7S3A2A0A539 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCRBV7S3A2A0A539 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCRBV7S3A2A0A539 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCRBV7S3A2A0A539 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCRBV7S3A2A0A539 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCRBV7S3A2A0A539 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCRBV7S3A2A0A539 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCRBV7S3A2A0A539 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCRBV7S3A2A0A539 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCRBV7S3A2A0A539 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCRBV7S3A2A0A539 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TCRBV7S3A2A0A539 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TCRBV7S3A2A0A539 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCRBV7S3A2A0A539 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCRBV7S3A2A0A539 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCRBV7S3A2A0A539 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TCRBV7S3A2A0A539 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCRBV7S3A2A0A539 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCRBV7S3A2A0A539 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCRBV7S3A2A0A539 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCRBV7S3A2A0A539 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCRBV7S3A2A0A539 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TCRBV7S3A2A0A539 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCRBV7S3A2A0A539 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCRBV7S3A2A0A539 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCRBV7S3A2A0A539 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCRBV7S3A2A0A539 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCRBV7S3A2A0A539 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCRBV7S3A2A0A539 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCRBV7S3A2A0A539 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCRBV7S3A2A0A539 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TCRBV7S3A2A0A539 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TCRBV7S3A2A0A539 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TCRBV7S3A2A0A539 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TCRBV7S3A2A0A539 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TCRBV7S3A2A0A539 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCRBV7S3A2A0A539 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCRBV7S3A2A0A539 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TCRBV7S3A2A0A539 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCRBV7S3A2A0A539 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms