Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PPK0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PPK0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A1W2PPK0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A1W2PPK0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A1W2PPK0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A1W2PPK0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
A0A1W2PPK0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A1W2PPK0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A1W2PPK0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A1W2PPK0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A1W2PPK0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A1W2PPK0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A1W2PPK0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A1W2PPK0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A1W2PPK0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A1W2PPK0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A1W2PPK0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A1W2PPK0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A1W2PPK0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A1W2PPK0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A1W2PPK0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A1W2PPK0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A1W2PPK0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A1W2PPK0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A1W2PPK0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A1W2PPK0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A1W2PPK0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A1W2PPK0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A1W2PPK0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A1W2PPK0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A1W2PPK0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A1W2PPK0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A1W2PPK0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A1W2PPK0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A1W2PPK0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A1W2PPK0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A1W2PPK0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A1W2PPK0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A1W2PPK0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A1W2PPK0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A1W2PPK0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A1W2PPK0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A1W2PPK0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A1W2PPK0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A1W2PPK0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A1W2PPK0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A1W2PPK0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A1W2PPK0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A1W2PPK0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A1W2PPK0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
A0A1W2PPK0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A1W2PPK0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A1W2PPK0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A1W2PPK0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A1W2PPK0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A1W2PPK0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A1W2PPK0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A1W2PPK0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A1W2PPK0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A1W2PPK0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A1W2PPK0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A1W2PPK0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A1W2PPK0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A1W2PPK0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A1W2PPK0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A1W2PPK0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A1W2PPK0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A1W2PPK0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A1W2PPK0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A1W2PPK0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A1W2PPK0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A1W2PPK0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A1W2PPK0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A1W2PPK0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A1W2PPK0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A1W2PPK0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A1W2PPK0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A1W2PPK0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A1W2PPK0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A1W2PPK0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A1W2PPK0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A1W2PPK0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A1W2PPK0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A1W2PPK0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A1W2PPK0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A1W2PPK0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A1W2PPK0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A1W2PPK0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A1W2PPK0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A1W2PPK0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A1W2PPK0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A1W2PPK0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A1W2PPK0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A1W2PPK0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A1W2PPK0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A1W2PPK0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
A0A1W2PPK0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A1W2PPK0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A1W2PPK0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A1W2PPK0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
A0A1W2PPK0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms