Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1C0

TRBV11-1, T-cell receptor beta variable 11-1 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV11-1A0A0K0K1C0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRBV11-1A0A0K0K1C0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRBV11-1A0A0K0K1C0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRBV11-1A0A0K0K1C0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRBV11-1A0A0K0K1C0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRBV11-1A0A0K0K1C0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRBV11-1A0A0K0K1C0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRBV11-1A0A0K0K1C0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRBV11-1A0A0K0K1C0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRBV11-1A0A0K0K1C0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRBV11-1A0A0K0K1C0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRBV11-1A0A0K0K1C0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRBV11-1A0A0K0K1C0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRBV11-1A0A0K0K1C0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRBV11-1A0A0K0K1C0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRBV11-1A0A0K0K1C0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRBV11-1A0A0K0K1C0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRBV11-1A0A0K0K1C0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRBV11-1A0A0K0K1C0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRBV11-1A0A0K0K1C0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRBV11-1A0A0K0K1C0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRBV11-1A0A0K0K1C0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRBV11-1A0A0K0K1C0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRBV11-1A0A0K0K1C0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRBV11-1A0A0K0K1C0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRBV11-1A0A0K0K1C0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRBV11-1A0A0K0K1C0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRBV11-1A0A0K0K1C0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRBV11-1A0A0K0K1C0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRBV11-1A0A0K0K1C0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRBV11-1A0A0K0K1C0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRBV11-1A0A0K0K1C0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRBV11-1A0A0K0K1C0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRBV11-1A0A0K0K1C0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRBV11-1A0A0K0K1C0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRBV11-1A0A0K0K1C0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRBV11-1A0A0K0K1C0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRBV11-1A0A0K0K1C0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRBV11-1A0A0K0K1C0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRBV11-1A0A0K0K1C0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRBV11-1A0A0K0K1C0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRBV11-1A0A0K0K1C0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRBV11-1A0A0K0K1C0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRBV11-1A0A0K0K1C0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRBV11-1A0A0K0K1C0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRBV11-1A0A0K0K1C0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRBV11-1A0A0K0K1C0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRBV11-1A0A0K0K1C0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRBV11-1A0A0K0K1C0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRBV11-1A0A0K0K1C0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRBV11-1A0A0K0K1C0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRBV11-1A0A0K0K1C0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRBV11-1A0A0K0K1C0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRBV11-1A0A0K0K1C0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRBV11-1A0A0K0K1C0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRBV11-1A0A0K0K1C0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRBV11-1A0A0K0K1C0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRBV11-1A0A0K0K1C0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRBV11-1A0A0K0K1C0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRBV11-1A0A0K0K1C0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRBV11-1A0A0K0K1C0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRBV11-1A0A0K0K1C0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRBV11-1A0A0K0K1C0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRBV11-1A0A0K0K1C0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRBV11-1A0A0K0K1C0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRBV11-1A0A0K0K1C0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRBV11-1A0A0K0K1C0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRBV11-1A0A0K0K1C0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRBV11-1A0A0K0K1C0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRBV11-1A0A0K0K1C0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRBV11-1A0A0K0K1C0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRBV11-1A0A0K0K1C0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRBV11-1A0A0K0K1C0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRBV11-1A0A0K0K1C0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRBV11-1A0A0K0K1C0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRBV11-1A0A0K0K1C0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRBV11-1A0A0K0K1C0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRBV11-1A0A0K0K1C0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRBV11-1A0A0K0K1C0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRBV11-1A0A0K0K1C0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRBV11-1A0A0K0K1C0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRBV11-1A0A0K0K1C0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRBV11-1A0A0K0K1C0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRBV11-1A0A0K0K1C0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRBV11-1A0A0K0K1C0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRBV11-1A0A0K0K1C0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRBV11-1A0A0K0K1C0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRBV11-1A0A0K0K1C0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRBV11-1A0A0K0K1C0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRBV11-1A0A0K0K1C0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRBV11-1A0A0K0K1C0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRBV11-1A0A0K0K1C0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRBV11-1A0A0K0K1C0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRBV11-1A0A0K0K1C0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRBV11-1A0A0K0K1C0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRBV11-1A0A0K0K1C0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRBV11-1A0A0K0K1C0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRBV11-1A0A0K0K1C0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRBV11-1A0A0K0K1C0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRBV11-1A0A0K0K1C0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms