Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms