Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC4A4Q9Y6R1 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms