Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms