Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNNQ9UQP3 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNNQ9UQP3 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNNQ9UQP3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNQ9UQP3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNQ9UQP3 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNQ9UQP3 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNQ9UQP3 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNQ9UQP3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms