Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms