Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms