Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNK4Q9NYG8 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms