Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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