Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms