Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms