Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms