Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms