Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms