Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms