Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms