Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYT17Q9BSW7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYT17Q9BSW7 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYT17Q9BSW7 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYT17Q9BSW7 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYT17Q9BSW7 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYT17Q9BSW7 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SYT17Q9BSW7 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYT17Q9BSW7 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYT17Q9BSW7 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYT17Q9BSW7 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYT17Q9BSW7 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SYT17Q9BSW7 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SYT17Q9BSW7 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYT17Q9BSW7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYT17Q9BSW7 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYT17Q9BSW7 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYT17Q9BSW7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SYT17Q9BSW7 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SYT17Q9BSW7 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SYT17Q9BSW7 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SYT17Q9BSW7 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYT17Q9BSW7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms