Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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