Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms