Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ65

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USB1Q9BQ65 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms