Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms