Protein–RNA interactions for Protein: Q99732

LITAF, Lipopolysaccharide-induced tumor necrosis factor-alpha factor, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LITAFQ99732 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LITAFQ99732 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms