Protein–RNA interactions for Protein: Q99643

SDHC, Succinate dehydrogenase cytochrome b560 subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHCQ99643 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHCQ99643 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHCQ99643 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHCQ99643 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHCQ99643 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHCQ99643 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHCQ99643 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHCQ99643 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHCQ99643 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHCQ99643 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHCQ99643 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHCQ99643 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHCQ99643 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHCQ99643 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHCQ99643 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHCQ99643 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHCQ99643 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHCQ99643 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHCQ99643 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHCQ99643 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHCQ99643 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHCQ99643 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHCQ99643 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHCQ99643 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHCQ99643 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHCQ99643 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHCQ99643 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHCQ99643 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHCQ99643 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHCQ99643 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHCQ99643 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHCQ99643 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHCQ99643 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHCQ99643 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHCQ99643 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHCQ99643 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHCQ99643 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHCQ99643 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHCQ99643 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHCQ99643 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHCQ99643 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHCQ99643 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHCQ99643 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHCQ99643 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHCQ99643 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHCQ99643 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHCQ99643 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHCQ99643 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHCQ99643 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHCQ99643 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHCQ99643 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHCQ99643 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHCQ99643 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHCQ99643 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SDHCQ99643 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SDHCQ99643 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SDHCQ99643 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SDHCQ99643 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SDHCQ99643 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SDHCQ99643 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SDHCQ99643 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SDHCQ99643 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SDHCQ99643 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SDHCQ99643 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SDHCQ99643 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHCQ99643 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHCQ99643 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHCQ99643 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHCQ99643 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHCQ99643 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHCQ99643 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHCQ99643 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHCQ99643 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHCQ99643 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHCQ99643 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHCQ99643 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHCQ99643 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHCQ99643 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHCQ99643 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHCQ99643 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHCQ99643 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHCQ99643 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHCQ99643 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHCQ99643 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHCQ99643 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHCQ99643 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHCQ99643 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHCQ99643 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHCQ99643 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHCQ99643 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHCQ99643 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHCQ99643 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHCQ99643 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHCQ99643 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHCQ99643 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHCQ99643 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHCQ99643 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHCQ99643 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHCQ99643 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHCQ99643 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms