Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKP4Q99569 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKP4Q99569 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKP4Q99569 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKP4Q99569 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKP4Q99569 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKP4Q99569 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKP4Q99569 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKP4Q99569 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PKP4Q99569 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKP4Q99569 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKP4Q99569 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKP4Q99569 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKP4Q99569 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKP4Q99569 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKP4Q99569 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKP4Q99569 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKP4Q99569 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKP4Q99569 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKP4Q99569 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKP4Q99569 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKP4Q99569 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKP4Q99569 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKP4Q99569 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKP4Q99569 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKP4Q99569 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKP4Q99569 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms