Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms