Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYNGAP1Q96PV0 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms