Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms