Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms