Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms