Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms