Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms