Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms