Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ5

CLIP3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP3Q96DZ5 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms