Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms