Protein–RNA interactions for Protein: Q93099

HGD, Homogentisate 1,2-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HGDQ93099 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HGDQ93099 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HGDQ93099 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HGDQ93099 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HGDQ93099 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HGDQ93099 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HGDQ93099 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HGDQ93099 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HGDQ93099 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HGDQ93099 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HGDQ93099 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HGDQ93099 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HGDQ93099 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HGDQ93099 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HGDQ93099 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HGDQ93099 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HGDQ93099 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HGDQ93099 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HGDQ93099 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HGDQ93099 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HGDQ93099 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HGDQ93099 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HGDQ93099 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HGDQ93099 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HGDQ93099 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HGDQ93099 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HGDQ93099 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HGDQ93099 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HGDQ93099 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HGDQ93099 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HGDQ93099 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HGDQ93099 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HGDQ93099 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HGDQ93099 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HGDQ93099 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HGDQ93099 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HGDQ93099 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HGDQ93099 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HGDQ93099 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HGDQ93099 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HGDQ93099 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HGDQ93099 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HGDQ93099 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HGDQ93099 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HGDQ93099 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HGDQ93099 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HGDQ93099 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HGDQ93099 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HGDQ93099 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HGDQ93099 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HGDQ93099 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HGDQ93099 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HGDQ93099 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HGDQ93099 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HGDQ93099 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HGDQ93099 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HGDQ93099 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HGDQ93099 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HGDQ93099 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HGDQ93099 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HGDQ93099 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HGDQ93099 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HGDQ93099 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HGDQ93099 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HGDQ93099 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HGDQ93099 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HGDQ93099 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HGDQ93099 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HGDQ93099 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HGDQ93099 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HGDQ93099 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HGDQ93099 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HGDQ93099 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HGDQ93099 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HGDQ93099 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HGDQ93099 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HGDQ93099 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HGDQ93099 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HGDQ93099 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HGDQ93099 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HGDQ93099 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HGDQ93099 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HGDQ93099 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HGDQ93099 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HGDQ93099 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HGDQ93099 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HGDQ93099 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HGDQ93099 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HGDQ93099 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HGDQ93099 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HGDQ93099 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HGDQ93099 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HGDQ93099 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HGDQ93099 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HGDQ93099 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HGDQ93099 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HGDQ93099 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HGDQ93099 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HGDQ93099 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HGDQ93099 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms