Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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USP9XQ93008 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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USP9XQ93008 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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USP9XQ93008 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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USP9XQ93008 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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USP9XQ93008 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP9XQ93008 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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