Protein–RNA interactions for Protein: Q92616

GCN1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCN1Q92616 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCN1Q92616 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GCN1Q92616 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCN1Q92616 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCN1Q92616 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCN1Q92616 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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GCN1Q92616 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCN1Q92616 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCN1Q92616 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCN1Q92616 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCN1Q92616 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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GCN1Q92616 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCN1Q92616 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCN1Q92616 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCN1Q92616 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCN1Q92616 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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GCN1Q92616 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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GCN1Q92616 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCN1Q92616 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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GCN1Q92616 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCN1Q92616 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCN1Q92616 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCN1Q92616 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCN1Q92616 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCN1Q92616 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCN1Q92616 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCN1Q92616 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCN1Q92616 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCN1Q92616 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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GCN1Q92616 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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GCN1Q92616 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCN1Q92616 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCN1Q92616 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCN1Q92616 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCN1Q92616 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCN1Q92616 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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GCN1Q92616 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCN1Q92616 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCN1Q92616 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCN1Q92616 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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GCN1Q92616 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCN1Q92616 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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GCN1Q92616 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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GCN1Q92616 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCN1Q92616 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCN1Q92616 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCN1Q92616 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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GCN1Q92616 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GCN1Q92616 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCN1Q92616 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCN1Q92616 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCN1Q92616 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCN1Q92616 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCN1Q92616 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCN1Q92616 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GCN1Q92616 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCN1Q92616 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GCN1Q92616 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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