Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms