Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms