Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms