Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC06

ACBD4, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD4Q8NC06 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms