Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AVL9Q8NBF6 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AVL9Q8NBF6 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AVL9Q8NBF6 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AVL9Q8NBF6 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AVL9Q8NBF6 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AVL9Q8NBF6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AVL9Q8NBF6 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AVL9Q8NBF6 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AVL9Q8NBF6 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AVL9Q8NBF6 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AVL9Q8NBF6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AVL9Q8NBF6 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AVL9Q8NBF6 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AVL9Q8NBF6 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AVL9Q8NBF6 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms