Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms