Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms