Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PLD3Q8IV08 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLD3Q8IV08 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLD3Q8IV08 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PLD3Q8IV08 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLD3Q8IV08 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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PLD3Q8IV08 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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PLD3Q8IV08 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
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PLD3Q8IV08 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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