Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms